1、分公司做年度汇算清缴，具体操作步骤如下：分清分支机构：总机构和具有主体生产经营职能的二级分支机构，就地分摊缴纳企业所得税。
2、应在汇算清缴期内由总、分机构分别结清应缴的企业所得税税款；预缴税款超过应税款的，主管税务机关应及时按有关规定分别办理退税，或者经总、分机构同意后分别抵缴其下一年度应缴企业所得税税款。
3、分公司企业所得税汇算清缴申报流程如下：首先去银行开立一个扣税账户。税务登记。分公司的也要办税务登记证，还要在领取营业执照后三十日内办理。申报纳税。
4、分公司 应当通过总公司汇总申报并缴纳企业所得税。如果是 子公司 ，是具有法人资格的，一般是就地申报并缴纳所得税。
5、第五条 以下二级分支机构不就地分摊缴纳企业所得税（一）不具有主体生产经营职能，且在当地不缴纳增值税、营业税的产品售后服务、内部研发、仓储等汇总纳税企业内部辅助性的二级分支机构，不就地分摊缴纳企业所得税。
6、可以不再新办税务登记证，但是要到总公司所在地税务机关办理备案手续 独立核算 能单独开立基本账户，能单独领用发票但也要缴纳税金（包括企业所得税）。
说了征收对象，接下来就要谈一谈对于非居民企业企业所得税的征收管理。情况一中的非居民企业取得的所得，适用25%的税率向所在地的税务机关申报，按照年度计算企业所得税，分月或者是季度预缴，年终时参与汇算。
汇缴企业应根据汇算清缴的期限要求，自行确定其成员企业向汇缴企业报送本办法第八条规定的有关资料的期限。成员企业向汇缴企业报送的上述资料，应经成员企业所在地的主管税务机关审核。
第一条在中华人民共和国境内，企业和其他取得收入的组织（以下统称企业）为企业所得税的纳税人，依照本法的规定缴纳企业所得税。个人独资企业、合伙企业不适用本法。第二条企业分为居民企业和非居民企业。
企业根据公司财务制度为职工提取离职补偿费，在进行年度企业所得税汇算清缴时，对当年度“预提费用”科目发生额进行纳税调整，待职工从企业离职并实际领取离职补偿费后，企业可按规定进行税前扣除。
企业发生的职工福利费支出，不超过工资、薪金总额14%的部分，准予扣除。
业务招待费支出：企业发生的与生产经营活动有关的业务招待费支出，按照发生额的60%扣除，但最高不得超过当年销售收入的千分之五。
企业所得税纳税扣除标准 企业发生的职工福利费支出，不超过工资薪金总额14%的部分，准予扣除。 企业拨缴的工会经费，不超过工资薪金总额2%的部分，准予扣除。
职工福利费支出按照不超过工资薪金总额14%的标准扣除。政策依据：《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第四十条？企业发生的职工福利费支出，不超过工资薪金总额14%的部分，准予扣除。
预缴税款。企业应当自年度终了之日起五个月内，向税务机关报送年度企业所得税纳税申报表，并汇算清缴，结清应缴应退税款。企业在报送企业所得税纳税申报表时，应当按照规定附送财务会计报告和其他有关资料。
企业所得税汇算清缴是指纳税人在纳税年度终了后规定时期内，依照税收法律、法规、规章及其他有关企业所得税的规定，自行计算全年应纳税所得额和应纳所得税额，结清全年企业所得税税款的行为。
金额有没有出入，税款是多缴了还是少缴了，多缴的可以退，少缴的可以补，简称多退少补，差不多就是这个意思。
征税以量能负担为原则。企业所得税以纳税人的生产经营所得和其他所得为计税依据，贯彻了量能负担的原则。所得多、负担能力大的，多纳税；所得少、负担能力小的，少纳税；无所得、没有负担能力的，不纳税。
所得多、负担能力大的多征，所得少、负担能力小的少征，无所得、没有负担能力的不征，体现税收公平的原则。税法对税基的约束力强。
内容不同：汇算清缴表是对年报的调整，根据所得税法进行了调增、调减；年报是根据会计账填写的，与总账科目是一致的；对象不同：年报是每年出版一次的定期刊物。又称年刊。
清算期间作为一个完整的纳税期间，缴纳所得税。企业的全部资产可变现价值或交易价格，减除资产的计税基础、清算费用、相关税费，加上债务清偿损益等后的余额，为清算所得。纳税人的生产经营一般要经历开业、发展、注销等阶段。